什么是 MCP？
MCP（Model Context Protocol）是 Anthropic 发明的一种通信协议。你可以把它理解成 AI 的"USB 接口"——统一标准，即插即用。
没有 MCP 的时候：AI 只能跟你聊天。有了 MCP：AI 可以读你的文件、查论文数据库、操作浏览器、发送邮件、管理数据库——像一个真正的助理。
Claude Code→MCP 协议→外部服务
MCP Server 是一个小程序，负责在 Claude Code 和外部服务之间当翻译。配置写在 .claude/mcp.json 文件里。
配置长什么样
{
"mcpServers": {
"arxiv": {
"command": "npx",
"args": ["-y", "@anthropic-ai/mcp-arxiv"]
}
}
}
加一行配置，重启 Claude Code，AI 就能查 arXiv 论文了。
文献搜索
arXiv MCP Server
官方
搜索 arXiv 论文、读取摘要、下载 PDF。Claude Code 内置支持。
arXiv论文搜索PDF 阅读
npx -y @anthropic-ai/mcp-arxiv
Academic Research MCP
9 API 合一
统一接入 9 个学术数据库：OpenAlex + Semantic Scholar + PubMed + arXiv + medRxiv/bioRxiv + CrossRef + Google Scholar + ORCID + Unpaywall。25 个工具，系统综述全流程。
9 源搜索ORCID系统综述Unpaywall
uvx academic-research-mcp
Paper Distill MCP
11 源并行
11 个学术源并行搜索（OpenAlex/Semantic Scholar/PubMed/arXiv/Papers with Code/CrossRef/Europe PMC/bioRxiv/DBLP/CORE/Unpaywall）。4 维加权排序、Zotero+Obsidian 集成。
并行搜索加权排序ZoteroObsidian
npx -y paper-distill-mcp
Paper Pilot
全文阅读
6 个学术数据库搜索，下载并全文阅读 PDF，提取证据、渲染图表。Zotero 同步。
全文阅读证据提取图表渲染Zotero
uvx paper-pilot demo "your topic"
Semantic Scholar MCP
官方
搜索 2.14 亿篇学术论文，获取引用关系、相关推荐、作者信息。
2.14亿论文引用分析作者信息
npx -y @anthropic-ai/mcp-semantic-scholar
PubMed MCP
医学专用
检索 PubMed 生物医学文献数据库。支持 MeSH 关键词、全文链接。
PubMed医学文献MeSH
npx -y mcp-pubmed
Scholar MCP
Google Scholar
搜索 Google Scholar、获取引用信息、下载论文 PDF。集成 Semantic Scholar + arXiv + bioRxiv。
Google Scholar引用PDF 下载
npx -y scholar-mcp
文献管理
Zotero MCP（Rust 版）
本地优先
直接操作本地 Zotero 库，34 个工具：搜索、PDF 文本提取、批注读取、DOI/ISBN/arXiv 查找、元数据补全、引文格式化（CSL）。数据不出机器。
ZoteroPDF 提取本地CSL 引文
npx -y zotero-mcp
ZotLink
预印本一键保存
一键保存 arXiv/CVF/bioRxiv/medRxiv/chemRxiv 论文到 Zotero。自动附加 PDF、丰富元数据。
Zotero预印本自动附加元数据
npx -y zotlink-mcp
MCP Research
多源+Zotero
arXiv + Semantic Scholar + Google Scholar + Zotero 集成。高级搜索语法、去重、论文推荐、BibTeX/RIS 导出。
多源搜索去重论文推荐BibTeX
npx -y mcp-research
论文写作与排版
Overleaf MCP
LaTeX 必备
通过 Git 桥接 Overleaf 项目。读取 .tex 文件、解析章节结构、提取内容。让 AI 直接操作你的 Overleaf 论文。
OverleafLaTeXGit 桥接
npx -y overleaf-mcp
PDF Reader MCP
科研必备
读取 PDF 全文、提取表格和图片、支持多页并行解析、嵌入图像识别。
PDF表格提取图片识别
npx -y pdf-reader-mcp
Reference Workbench
学术专用
验证参考文献真实性、检查引用格式、生成文献综述。支持 PDF/DOCX/Markdown/LaTeX。
引用验证文献综述格式检查
npx -y reference-workbench-mcp
BibTeX MCP
引文管理
从 DOI/arXiv ID/URL 自动生成 BibTeX 条目。批量处理、去重、格式校验。
BibTeXDOI批量处理
npx -y bibtex-mcp
数据分析与可视化
Python Sandbox MCP
科研必备
安全运行 Python 代码。AI 可以做数据清洗、统计分析、机器学习建模——在一个隔离的沙箱里。
Python数据分析机器学习沙箱
npx -y mcp-python
Matplotlib MCP
图表生成
生成出版级质量的图表。AI 可以直接创建科研论文中的折线图、散点图、热力图、3D 图。
可视化图表论文配图
npx -y mcp-matplotlib
Research MCP Aggregator
工程仿真
文献（arXiv/Zotero）+ PDF 解析（MinerU）+ 仿真（COMSOL/Fluent/PFC/MATLAB）+ 绘图（Matplotlib/OriginLab）+ 写作（BibTeX/LaTeX 编译/docx）
仿真COMSOLMATLABMinerU
npx -y research-mcp-aggregator
Jupyter MCP
Notebook
连接 Jupyter Notebook/Lab。读取、创建、执行 notebook cells，AI 帮你跑实验记录结果。
JupyterNotebook实验记录
npx -y jupyter-mcp
FileSystem MCP
官方
读写本地文件、搜索目录、批量处理文档。AI 可以访问你指定的文件夹。科研数据管理基础工具。
文件系统读写搜索
npx -y @anthropic-ai/mcp-filesystem /path/to/dir
Docker MCP
容器管理
管理 Docker 容器、镜像、网络。AI 可以帮你部署实验环境、调试容器。
Docker容器环境部署
npx -y mcp-docker